斑马贻贝基因组

遗传学
研究目标

斑马贻贝(多形饰贝)是一种淡水入侵物种已经在整个欧洲和北美的航道传播。经济影响包括数十亿的发电行业以及娱乐和旅游损害美元。侵入蚌也排挤本地物种,破坏这些物种的食物来源,因为他们删除了大量浮游植物的水,并有可能导致食物网戏剧性的变化。尽管许多研究人员一直在研究 d。多形,出现了迄今所做有点遗传的工作。

 

我们如何工作与研究
微星工作人员与MSI合作PIS迈克尔·麦卡特尼(明尼苏达州的水生入侵物种研究中心和渔业,野生动物的主管部门,以及保护生物学)和肯尼思·贝克曼(主任,明尼苏达州基因组学中心的大学)及其研究小组的成员。其他参加者来自多伦多大学,相基因组学和国家人类基因组研究所。微星提供获得先进的基因组学软件。微星工作人员分析数据,并帮助组装和注释的基因组。

结果

  • 研究人员用长读测序和脚手架技术,产生高重复的斑马贻贝基因组的染色体规模的集会。这代表了最高质量的贝类基因组组装日期。
  • 这个基因在生命之树有很大的差距填补斑马贻贝是400多万元年,由最近的测序相对分歧。这大致是进化分歧为人类和鳐鱼之间的相同的量。
  • 基因组提供了深入了解是对于斑纹贻贝,包括壳形成,足丝线状体安装纤维(其促进它们附接到表面和扩散的水体之间)的合成,以及热应力响应的侵入成功是重要的过程。 
  • 研究人员发现,斑马贻贝在任何动物最大的线粒体基因组的研究迄今。这个不寻常的线粒体基因组结构的原因目前还不清楚。
  • 这种染色体级装配是在这个基础和应用研究及相关侵入双壳类一个强大的新工具。研究人员确定了几个基因与壳生长和硬化的作用,足丝线程分泌和附件,以及热和其他应激的耐受性。这些和其他用于控制技术的发展目标。

纸可以在biorxiv网站上写着: 斑马贻贝的基因组中, 多形饰贝:为入侵物种的研究资源. 迈克尔。麦卡特尼本杰明·奥赫, 托马斯·科诺苏菲mallez, 张颖,安吉利科obille,艾伦·贝克尔,胡安即abrahante,约翰GARBE,乔纳森页。巴达拉门蒂, 亚当·赫尔曼海莉mangelson,伊万liachko,肖恩沙利文,以利d。曾根谢尔盖·科伦, 凯文A.T.西尔弗斯坦, 肯尼思湾贝克曼达里尔米。 gohl。 2019年(MI PIS以粗体显示,微星工作人员为斜体)